Is é an tréimhse bioloíoch den phróiseas glanaithe an chúisithe ar leibhéal dara céime atá i gceist le córais chóilíochta uisce. Is é príomhaidhm an chéime seo ná baint as ábhar orgánach tuaslagtha agus colóidigh a fhanann tar éis an tsedimeintithe. Baileann sé seo go príomha le húsáid mícreachair (bacail, proitiseacha) a itheann pollúntáirí orgánacha mar bhia. Cuimsíonn teicneolaíochtaí coitianta próisis slaine ailtéirithe, scagairí titim, comhthacaightheoirí rothlacha bitheolaíocha (RBCs), agus imathóirí bealach le rátaíocht (SBRs). Bíonn sláinte agus éifeachtúlacht na heacóscosmanna bio-loíocha seo ag brath go hiomlán ar cháilíocht an uisce a fhágtar orthu ón gcéim chiardaithe tosaigh. Seo áit ar bhíonn an nasc thábhachtach leis an tsedimeintiú tosaigh ann. Mura bhfuil an claraitheoir tosaigh ró-éifeachtach i mbaint de mhíre sholadacha ina seasamh, rithfidh na míre sin thar lear isteach i gcomhthacaightheoirí an chóilíochta dara céime. D'fhéadfadh sé seo a bheith ina chúis le forluchadh ar an mbhiosráite, éileamh mó ar ocsaigine, tuirse don tsedimeintithe sa chiaraitheoirí dara céime, agus ar deireadh, neamhthéacht le spriocanna BOD a bhaint amach. Tugann scrabhlóirí luma neamh-mhailleacha Huake páirt indírí ach thábhachtach i bhfheidhmiúchán an chóilíochta dara céime. Trí chinntiú go bhfeidhmíonn an claraitheoir tosaigh ar a bharr de bharr bainte slánaithe sluma daoncha agus leanúnach, soláthraímid béim ardchaighdeáin go leanúnach don chéim bhitheolaíoch. Ligeann sé seo do na micreachair feidhmiú go hoifigiúil, ag cinntiú go mbaintear an méid is mó a dh’fhéadfadh a bheith ann d’iomarcaigh amach agus go ndéantar toradh ardchaighdeáin uisce a ghlanadh go maith nó a ascaoradh.