Atık suyun ikincil arıtması, birincil arıtmayı takip eden biyolojik arıtma aşamasıdır. Amacı, çöktürme işleminden sonra kalan çözünmüş ve kolloidal organik maddelerin giderilmesidir. Bu süreç, organik kirleticileri besin olarak tüketen mikroorganizmalar (bakteriler, protozoalar) kullanılarak gerçekleştirilir. Yaygın teknolojiler arasında aktif çamur prosesleri, damlatmalı filtreler, döner biyolojik kontaktörler (RBC'ler) ve ardışık partiler hâlinde çalışan reaktörler (SBR'ler) yer alır. Bu biyolojik ekosistemlerin sağlığı ve verimliliği, birincil arıtma aşamasından aldıkları çıkış suyunun kalitesine tamamen bağlıdır. İşte burada birincil çökeltimle kritik bağlantı kurulur. Eğer birincil çökeltici yeterli miktarda askıda katıyı gideremezse, bu katılar ikincil arıtma biyoreaktörlerine taşar. Bu durum, biyokütlenin aşırı yüklenmesine, artan oksijen ihtiyacına, ikincil çökelticilerde kötü çökelmeye ve sonuç olarak biyokimyasal oksijen ihtiyacı (BOD) giderme hedeflerinin karşılanamamasına neden olabilir. Huake'nin metal olmayan çamur kazıyıcıları, ikincil arıtmayı dolaylı ancak hayati bir şekilde korur. Birincil çökelticinin güvenilir ve sürekli çamur uzaklaştırması sayesinde en yüksek verimle çalışmasını sağlayarak, biyolojik aşamaya sürekli ve yüksek kaliteli bir giriş akımı sunar. Bu da mikroorganizmaların optimal şekilde çalışmasını sağlar ve ikincil arıtma sürecinin maksimum kirletici giderim verimliliğini yakalamasını, ayrıca daha ileri parlatma veya deşarj için uygun yüksek kaliteli bir çıkış suyu üretmesini sağlar.