Skrapere i sekundæravsugningstanken, også kjent som slamskrapere i sluttklaringstank, opererer i et vesentlig annerledes miljø enn sin primære motpart. Dens funksjon er å forsiktig skille den biologisk behandlede aktiverte slammet fra det rensede vannet. Det avsatte materialet er en skjør flokulert masse av mikroorganismer som lett kan skjæres og løses opp igjen hvis det forstyrres kraftig. Derfor må sekundærskraperen prioritere svært forsiktig og kontinuerlig drift. Hastighetskontroll er kritisk; den må bevege seg sakte nok til å unngå strømmer som kan løfte opp faste stoffer og dermed redusere kvaliteten på utløpsvannet. Konstruksjonen inkluderer ofte egenskaper som dypt plasserte tverrbjelker på samlerarmene for å minimere overflateturbulens, samt spesielt designede skjær for å sikre fullstendig innsamling uten resuspensjon. En del av dette samlede slammet returneres til luftingstanken (Return Activated Sludge – RAS) for å vedlikeholde mikrobiell populasjon, mens overskuddsslammet fjernes (Waste Activated Sludge – WAS). Presisjon og pålitelighet til skrapere i sekundæravsugningstanken er avgjørende for hele prosessen med aktivert slam. Dets ytelse styrer direkte konsentrasjonen av mikroorganismer i de biologiske reaktorene og kvaliteten på det endelige utløpsvannet som ledes ut i miljøet. Enhver feil kan føre til prosessbrudd og alvorlige brudd på tillatelseskrav.